RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.44■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 LTKP29376 864 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 ITSN1Q15811 1721 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 AKAP12Q02952 1782 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
LRRTM1-202ENST00000409148 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 DIP2AQ14689 1571 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 BCAR3O75815 825 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 POLKQ9UBT6 870 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 PTPRUQ92729 1446 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 TBX22Q9Y458 520 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.33■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NME9Q86XW9 330 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 COG3Q96JB2 828 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 PTCH1Q13635 1447 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 FCHSD2O94868 740 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 PDE3AQ14432 1141 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 IL16Q14005 1332 aa22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NEFMP07197 916 aa22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1-202ENST00000409148 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.27■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MS4A1P11836 297 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FBLN1P23142 703 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RIPK4P57078 832 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ACEP12821 1306 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 USP6P35125 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PRKAR2BP31323 418 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 IL13P35225 146 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PIK3R4Q99570 1358 aa22.2■■□□□ 1.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NUTM2FA1L443 756 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 AAMPQ13685 434 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PANK1Q8TE04 598 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HMOX1P09601 288 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NFE2L2Q16236 605 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 COG6Q9Y2V7 657 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SSH2Q76I76 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 PDE4AP27815 886 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 USP31Q70CQ4 1352 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-202ENST00000409148 BACH2Q9BYV9 841 aa22.11■■□□□ 1.13
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