RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF521Q96K83 1311 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 IGF1RP08069 1367 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 SOX12O15370 315 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 PPP2R1AP30153 589 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF592Q92610 1267 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 NPHP1O15259 732 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 KRT222Q8N1A0 295 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 RGL3Q3MIN7 710 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 SHROOM2Q13796 1616 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 NUP160Q12769 1436 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 KDM5CP41229 1560 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 KIF2CQ99661 725 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 GRIN2AQ12879 1464 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 TULP2O00295 520 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 CLGNO14967 610 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 GYS2P54840 703 aa11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 KIF18AQ8NI77 898 aa11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 IFT57Q9NWB7 429 aa11.59□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 TNNT1P13805 278 aa11.58□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.58□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 FAM193AP78312 1265 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 GTF3C6Q969F1 213 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3O95983 291 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 CEP170Q5SW79 1584 aa11.56□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 NEK11Q8NG66 645 aa11.56□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.56□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 BANK1Q8NDB2 785 aa11.56□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 PSEN1P49768 467 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DRC7Q8IY82 874 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM66O15016 1216 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 EFCC1Q9HA90 598 aa11.55□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 TMF1P82094 1093 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 DRC1Q96MC2 740 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ZMYM3Q14202 1370 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 PHF14O94880 888 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-203ENST00000395211 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 PTGS1P23219 599 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 INSRP06213 1382 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms