RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393888.1

CNP-201, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNP, Length 2,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-201ENST00000393888 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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CNP-201ENST00000393888 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CNP-201ENST00000393888 ABCC1P33527 1531 aa20.52■□□□□ 0.88
CNP-201ENST00000393888 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.52■□□□□ 0.88
CNP-201ENST00000393888 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.52■□□□□ 0.88
CNP-201ENST00000393888 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.51■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.51■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.5■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 NOS1P29475 1434 aa20.5■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 AK9Q5TCS8 1911 aa20.5■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 ADGRL1O94910 1474 aa20.48■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 MYOM2P54296 1465 aa20.48■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.48■□□□□ 0.87
CNP-201ENST00000393888 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.46■□□□□ 0.87
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CNP-201ENST00000393888 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.45■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.45■□□□□ 0.86
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CNP-201ENST00000393888 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.44■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.44■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 DEPDC5O75140 1603 aa20.44■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 ADGRB2O60241 1585 aa20.43■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.42■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.42■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 MCTP1Q6DN14 999 aa20.41■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.41■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 IFT172Q9UG01 1749 aa20.4■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 KIF16BQ96L93 1317 aa20.4■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.4■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNP-201ENST00000393888 PTMSP20962 102 aa20.39■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.39■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.39■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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CNP-201ENST00000393888 ABCC11Q96J66 1382 aa20.38■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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CNP-201ENST00000393888 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.37■□□□□ 0.85
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CNP-201ENST00000393888 NEO1Q92859 1461 aa20.36■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.36■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 EVC2Q86UK5 1308 aa20.35■□□□□ 0.85
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CNP-201ENST00000393888 RBSNQ9H1K0 784 aa20.35■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 USP32Q8NFA0 1604 aa20.34■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.34■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.34■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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CNP-201ENST00000393888 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.33■□□□□ 0.85
CNP-201ENST00000393888 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.33■□□□□ 0.84
CNP-201ENST00000393888 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.33■□□□□ 0.84
CNP-201ENST00000393888 IL16Q14005 1332 aa20.33■□□□□ 0.84
CNP-201ENST00000393888 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CNP-201ENST00000393888 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.32■□□□□ 0.84
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