RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.27■■■□□ 2.44
CHST6-202ENST00000390664 NEFLP07196 543 aa30.26■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 PDE3BQ13370 1112 aa30.25■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.25■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.24■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.24■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 COG3Q96JB2 828 aa30.23■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.21■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CHST6-202ENST00000390664 SSH2Q76I76 1423 aa30.2■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 FKBP8Q14318 412 aa30.19■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 HSPA2P54652 639 aa30.19■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.18■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.18■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.17■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 APAF1O14727 1248 aa30.16■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 POLKQ9UBT6 870 aa30.16■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.16■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.16■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 C14orf37Q86TY3 774 aa30.16■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.15■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 FBLN1P23142 703 aa30.15■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.14■■■□□ 2.42
CHST6-202ENST00000390664 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 RUNDC1Q96C34 613 aa30.13■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.12■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 NGEFQ8N5V2 710 aa30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 ZNF521Q96K83 1311 aa30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 PIK3C2AO00443 1686 aa30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.11■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 STRCQ7RTU9 1775 aa30.1■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.1■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.08■■■□□ 2.41
CHST6-202ENST00000390664 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 USP31Q70CQ4 1352 aa30.05■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 USP54Q70EL1 1684 aa30.04■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 GOLGA2Q08379 1002 aa30.04■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.03■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.02■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CHST6-202ENST00000390664 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 C19orf44Q9H6X5 657 aa30■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 TMEM94Q12767 1356 aa29.99■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 PEAK1Q9H792 1746 aa29.98■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.98■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.97■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.97■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.97■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 NEUROD2Q15784 382 aa29.97■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 KIF1AQ12756 1690 aa29.96■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 WWC1Q8IX03 1113 aa29.95■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.95■■■□□ 2.39
CHST6-202ENST00000390664 SLFN5Q08AF3 891 aa29.95■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.95■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.95■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 IL13P35225 146 aa29.94■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 NLRP6P59044 892 aa29.94■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 DCCP43146 1447 aa29.94■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 SOX12O15370 315 aa29.93■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 ABTB2Q8N961 1025 aa29.93■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.93■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 FCHSD2O94868 740 aa29.92■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 ORAI2Q96SN7 254 aa29.92■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 PSME1Q06323 249 aa29.92■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 CCDC27Q2M243 656 aa29.92■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 E9PSI1 815 aa29.91■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 ATF3P18847 181 aa29.89■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.89■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CHST6-202ENST00000390664 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.89■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.89■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.89■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.88■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 MST1RQ04912 1400 aa29.87■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 SBNO1A3KN83 1393 aa29.86■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 HMOX1P09601 288 aa29.86■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 PRKAR2BP31323 418 aa29.86■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 FOXO3O43524 673 aa29.85■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 NEFMP07197 916 aa29.85■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 FLT4P35916 1363 aa29.85■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 WDR63Q8IWG1 891 aa29.84■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms