RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.07□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.07□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 C14orf37Q86TY3 774 aa9.07□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NEFMP07197 916 aa9.06□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 RUNDC1Q96C34 613 aa9.06□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.06□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 DCCP43146 1447 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 USP31Q70CQ4 1352 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 SSH2Q76I76 1423 aa9.05□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NME9Q86XW9 330 aa9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.04□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM2FA1L443 756 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 GOLGA2Q08379 1002 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 POLKQ9UBT6 870 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.03□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.02□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 SHPRHQ149N8 1683 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 FCHSD2O94868 740 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 ATF3P18847 181 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC27Q2M243 656 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF1AQ12756 1690 aa9.01□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 E9PSI1 815 aa9.01□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 APAF1O14727 1248 aa9.01□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 MSH6P52701 1360 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 PSME1Q06323 249 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 ESCO1Q5FWF5 840 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 WDR63Q8IWG1 891 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 USP54Q70EL1 1684 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF521Q96K83 1311 aa9□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 TMEM94Q12767 1356 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 HSPA2P54652 639 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 NLRP6P59044 892 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 SBNO1A3KN83 1393 aa8.99□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 FKBP8Q14318 412 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 ABTB2Q8N961 1025 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 RTL1A6NKG5 1358 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 FLT4P35916 1363 aa8.98□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 IL13P35225 146 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 SLFN5Q08AF3 891 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 WWC1Q8IX03 1113 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 IL16Q14005 1332 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.97□□□□□ -0.97
KCNQ1-204ENST00000380776 AMPHP49418 695 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 STRCQ7RTU9 1775 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 MST1RQ04912 1400 aa8.96□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PIK3C2AO00443 1686 aa8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGEF10O15013 1369 aa8.95□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.94□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.94□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.94□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PRKAR2BP31323 418 aa8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 NFE2L2Q16236 605 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms