RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

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Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
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TMOD1-202ENST00000375175 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.77■□□□□ 0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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TMOD1-202ENST00000375175 USP19O94966 1318 aa16.75■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RICTORQ6R327 1708 aa16.75■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.75■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PTPRMP28827 1452 aa16.74■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRB2O60241 1585 aa16.74■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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TMOD1-202ENST00000375175 CABP1Q9NZU7 370 aa16.74■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.73■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.73■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.72■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.71■□□□□ 0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
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TMOD1-202ENST00000375175 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.7■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.69■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.69■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 IL16Q14005 1332 aa16.69■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 ARXQ96QS3 562 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ALKQ9UM73 1620 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FBLN1P23142 703 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.68■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 MED14O60244 1454 aa16.67■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 NLRP1Q9C000 1473 aa16.66■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 FCHSD2O94868 740 aa16.65■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.65■□□□□ 0.26
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TMOD1-202ENST00000375175 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.65■□□□□ 0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ZMYND15Q9H091 742 aa16.64■□□□□ 0.25
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TMOD1-202ENST00000375175 ZMYM3Q14202 1370 aa16.64■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.64■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.64■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MLECQ14165 292 aa16.63■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 POLKQ9UBT6 870 aa16.63■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 HMOX1P09601 288 aa16.62■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KIF16BQ96L93 1317 aa16.62■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.61■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.6■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.6■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PANK2Q9BZ23 570 aa16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.59■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.58■□□□□ 0.25
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.58■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NFE2L2Q16236 605 aa16.58■□□□□ 0.24
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TMOD1-202ENST00000375175 NME9Q86XW9 330 aa16.57■□□□□ 0.24
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TMOD1-202ENST00000375175 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.57■□□□□ 0.24
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TMOD1-202ENST00000375175 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.57■□□□□ 0.24
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TMOD1-202ENST00000375175 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.56■□□□□ 0.24
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TMOD1-202ENST00000375175 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.56■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ATP7BP35670 1465 aa16.56■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TSPOAP1O95153 1857 aa16.56■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.55■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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