RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370546.5

HPSE2-201, Transcript of heparanase 2 (inactive), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPSE2, Length 1,849 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2-201ENST00000370546 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.53■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.52■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 TNNQ9UQP3 1299 aa16.52■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.52■□□□□ 0.24
HPSE2-201ENST00000370546 ALKQ9UM73 1620 aa16.52■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 DLC1Q96QB1 1528 aa16.51■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.51■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.5■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 SEC24BO95487 1268 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 FYB1O15117 783 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 STK26Q9P289 416 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.49■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 PRAM1Q96QH2 718 aa16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 REREQ9P2R6 1566 aa16.48■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 ATP7BP35670 1465 aa16.47■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 POGKQ9P215 609 aa16.47■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 KIF16BQ96L93 1317 aa16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.46■□□□□ 0.23
HPSE2-201ENST00000370546 TRIM27P14373 513 aa16.45■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.45■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.44■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.43■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 AGLP35573 1532 aa16.43■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 FCHSD2O94868 740 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 RIPK4P57078 832 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 ZNF428Q96B54 188 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 IL27Q8NEV9 243 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 CDK19Q9BWU1 502 aa16.42■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.41■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 SMC5Q8IY18 1101 aa16.41■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.41■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.4■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.4■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HPSE2-201ENST00000370546 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 CABP1Q9NZU7 370 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.38■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.36■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.36■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 PIK3R4Q99570 1358 aa16.36■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 PTCH1Q13635 1447 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 POLKQ9UBT6 870 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.35■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 PRKAR2BP31323 418 aa16.34■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 NFE2L2Q16236 605 aa16.34■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.34■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 DIP2BQ9P265 1576 aa16.34■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.34■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 NUCB1Q02818 461 aa16.33■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.33■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.33■□□□□ 0.21
HPSE2-201ENST00000370546 AKAP12Q02952 1782 aa16.31■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 IFT57Q9NWB7 429 aa16.31■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 ITSN1Q15811 1721 aa16.31■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 GNAI1P63096 354 aa16.3■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.29■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.29■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.29■□□□□ 0.2
HPSE2-201ENST00000370546 C3P01024 1663 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms