RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCNH2Q12809 1159 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC01559Q495D7 138 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAP1Q92560 729 aa4.82□□□□□ -1.64
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RNU6-407P-201ENST00000365280 DESI1Q6ICB0 168 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.81□□□□□ -1.64
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RNU6-407P-201ENST00000365280 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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RNU6-407P-201ENST00000365280 PRR7Q8TB68 274 aa4.78□□□□□ -1.64
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RNU6-407P-201ENST00000365280 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITPKCQ96DU7 683 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-407P-201ENST00000365280 ARID5BQ14865 1188 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.75□□□□□ -1.65
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RNU6-407P-201ENST00000365280 NR3C2P08235 984 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFV2P19404 249 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-407P-201ENST00000365280 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.7□□□□□ -1.66
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RNU6-407P-201ENST00000365280 BARGINQ6ZT62 677 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
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RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARHGEF15O94989 841 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 HRCP23327 699 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-407P-201ENST00000365280 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.67□□□□□ -1.66
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