RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 SMARCE1Q969G3 411 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 MNS1Q8NEH6 495 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KINO60870 393 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 MRE11P49959 708 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 IQCEQ6IPM2 695 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CDKL5O76039 1030 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CRBNQ96SW2 442 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 OFD1O75665 1012 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 DACH1Q9UI36 760 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 APAF1O14727 1248 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 TOPBP1Q92547 1522 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 STIM1Q13586 685 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FSD1Q9BTV5 496 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 IFT57Q9NWB7 429 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 WDR63Q8IWG1 891 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ERLIN2O94905 339 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 DESP17661 470 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 SDF4Q9BRK5 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 GNAI2P04899 355 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CAGE1Q8TC20 777 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF592Q92610 1267 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 WASF1Q92558 559 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC66A2RUB6 948 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ERBINQ96RT1 1412 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 RAD21O60216 631 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 WASHC4Q2M389 1173 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ARAP1Q96P48 1450 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PRXQ9BXM0 1461 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2FA1L443 756 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 KRT32Q14532 448 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NSD2O96028 1365 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CBFA2T2O43439 604 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC192P0DO97 292 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 MSH5O43196 834 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC11Q96J66 1382 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 SYCP1Q15431 976 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP6P59044 892 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 PDE4CQ08493 712 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-201ENST00000356100 ABTB2Q8N961 1025 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-201ENST00000356100 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms