RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 SIRT1Q96EB6 747 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 USP32Q8NFA0 1604 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 LRP6O75581 1613 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 RGS3P49796 1198 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 SHPRHQ149N8 1683 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 ABCC11Q96J66 1382 aa9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 FOXO3O43524 673 aa9.56□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.56□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.56□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 GSE1Q14687 1217 aa9.55□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 POGKQ9P215 609 aa9.55□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.55□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.54□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.54□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 POTEAQ6S8J7 498 aa9.52□□□□□ -0.88
CCR6-202ENST00000349984 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.52□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTS2O95450 1211 aa9.52□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.51□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PXDNQ92626 1479 aa9.51□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 JCADQ9P266 1359 aa9.51□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.51□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.5□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.5□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 CABP2Q9NPB3 220 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 AKAP12Q02952 1782 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 C8orf37Q96NL8 207 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 CDK19Q9BWU1 502 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 TONSLQ96HA7 1378 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 ATP7BP35670 1465 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.47□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CCR6-202ENST00000349984 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 ABCA3Q99758 1704 aa9.46□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 AFF2P51816 1311 aa9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 ALS2Q96Q42 1657 aa9.45□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.44□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.44□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 PSME1Q06323 249 aa9.44□□□□□ -0.9
CCR6-202ENST00000349984 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.44□□□□□ -0.9
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