RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF428Q96B54 188 aa22.86■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.86■■□□□ 1.25
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KRCC1-201ENST00000347055 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.86■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 EVC2Q86UK5 1308 aa22.86■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.86■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM27P14373 513 aa22.85■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.85■■□□□ 1.25
KRCC1-201ENST00000347055 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.84■■□□□ 1.25
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KRCC1-201ENST00000347055 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.84■■□□□ 1.25
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KRCC1-201ENST00000347055 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.83■■□□□ 1.24
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KRCC1-201ENST00000347055 CD109Q6YHK3 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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KRCC1-201ENST00000347055 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.81■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.8■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 CFAP44Q96MT7 982 aa22.8■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.79■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.79■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 PANK2Q9BZ23 570 aa22.79■■□□□ 1.24
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KRCC1-201ENST00000347055 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.78■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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KRCC1-201ENST00000347055 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 NPATQ14207 1427 aa22.78■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
KRCC1-201ENST00000347055 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.77■■□□□ 1.24
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KRCC1-201ENST00000347055 GCC1Q96CN9 775 aa22.76■■□□□ 1.23
KRCC1-201ENST00000347055 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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KRCC1-201ENST00000347055 PIK3R4Q99570 1358 aa22.76■■□□□ 1.23
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KRCC1-201ENST00000347055 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.73■■□□□ 1.23
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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KRCC1-201ENST00000347055 TPM2P07951 284 aa22.72■■□□□ 1.23
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KRCC1-201ENST00000347055 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.71■■□□□ 1.23
KRCC1-201ENST00000347055 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.71■■□□□ 1.23
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.71■■□□□ 1.23
KRCC1-201ENST00000347055 ASXL2Q76L83 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PP64 1363 aa22.69■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.68■■□□□ 1.22
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KRCC1-201ENST00000347055 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.67■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.67■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 KIF2CQ99661 725 aa22.66■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 TERF1P54274 439 aa22.65■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.64■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.64■■□□□ 1.22
KRCC1-201ENST00000347055 FCHSD2O94868 740 aa22.63■■□□□ 1.21
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KRCC1-201ENST00000347055 HS1BP3Q53T59 392 aa22.63■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 ARXQ96QS3 562 aa22.63■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.63■■□□□ 1.21
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KRCC1-201ENST00000347055 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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KRCC1-201ENST00000347055 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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KRCC1-201ENST00000347055 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 CDC45O75419 566 aa22.61■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.61■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 ERBB4Q15303 1308 aa22.6■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.6■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.6■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 RABEP1Q15276 862 aa22.59■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.59■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.59■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 PTPRMP28827 1452 aa22.59■■□□□ 1.21
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF445P59923 1031 aa22.58■■□□□ 1.21
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