RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.05■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 USP6P35125 1406 aa37.04■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 APAF1O14727 1248 aa37.02■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF521Q96K83 1311 aa37.02■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 NGEFQ8N5V2 710 aa37.01■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.01■■■■□ 3.52
CCZ1-201ENST00000325974 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.01■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 CDCA7LQ96GN5 454 aa37.01■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 COG3Q96JB2 828 aa37■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 NWD1Q149M9 1564 aa37■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.99■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 RUNDC1Q96C34 613 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 POLKQ9UBT6 870 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 SSH2Q76I76 1423 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.96■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.95■■■■□ 3.51
CCZ1-201ENST00000325974 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.94■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.93■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 FBLN1P23142 703 aa36.91■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.9■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.9■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 GOLGA2Q08379 1002 aa36.89■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.89■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.89■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
CCZ1-201ENST00000325974 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.87■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.87■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.85■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.84■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.83■■■■□ 3.49
CCZ1-201ENST00000325974 SLFN5Q08AF3 891 aa36.81■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.8■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 USP31Q70CQ4 1352 aa36.8■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 C14orf37Q86TY3 774 aa36.78■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 WWC1Q8IX03 1113 aa36.78■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.78■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 PIK3C2AO00443 1686 aa36.76■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 HSPA2P54652 639 aa36.76■■■■□ 3.48
CCZ1-201ENST00000325974 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC27Q2M243 656 aa36.74■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 E9PSI1 815 aa36.73■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 NEUROD2Q15784 382 aa36.72■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.72■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 IL13P35225 146 aa36.71■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 FCHSD2O94868 740 aa36.71■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.7■■■■□ 3.47
CCZ1-201ENST00000325974 USP54Q70EL1 1684 aa36.69■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.69■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 RRP1P56182 461 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.69■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.67■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.66■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 WDR63Q8IWG1 891 aa36.66■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.65■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.64■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 PEAK1Q9H792 1746 aa36.64■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
CCZ1-201ENST00000325974 PPP4R2Q9NY27 417 aa36.63■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 NLRP6P59044 892 aa36.62■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 STRCQ7RTU9 1775 aa36.62■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.61■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 PRKAR2BP31323 418 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 ABTB2Q8N961 1025 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM94Q12767 1356 aa36.58■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.57■■■■□ 3.45
CCZ1-201ENST00000325974 SOX12O15370 315 aa36.57■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 PSME1Q06323 249 aa36.57■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 NEFMP07197 916 aa36.56■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 HMOX1P09601 288 aa36.56■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 ORAI2Q96SN7 254 aa36.56■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 SBNO1A3KN83 1393 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 DCCP43146 1447 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 KIF1AQ12756 1690 aa36.53■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.53■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 FLT4P35916 1363 aa36.52■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.52■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.52■■■■□ 3.44
CCZ1-201ENST00000325974 RIPK4P57078 832 aa36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms