RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.65■■□□□ 1.54
NHLH2-201ENST00000320238 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
NHLH2-201ENST00000320238 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.63■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.63■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.63■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.62■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.62■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.62■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 HMOX1P09601 288 aa24.61■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM27P14373 513 aa24.6■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.6■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 USP19O94966 1318 aa24.59■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.59■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 ALKQ9UM73 1620 aa24.58■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 NFKBIBQ15653 356 aa24.58■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 NLRP1Q9C000 1473 aa24.58■■□□□ 1.53
NHLH2-201ENST00000320238 PRKAR2BP31323 418 aa24.58■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.58■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 POLKQ9UBT6 870 aa24.57■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.56■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.55■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.55■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 NME9Q86XW9 330 aa24.54■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 TSPOAP1O95153 1857 aa24.54■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 USP35Q9P2H5 1018 aa24.53■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRB2O60241 1585 aa24.52■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.52■■□□□ 1.52
NHLH2-201ENST00000320238 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.51■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.51■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.49■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.49■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 NUTM2FA1L443 756 aa24.49■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 METP08581 1390 aa24.48■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.48■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 FCHSD2O94868 740 aa24.48■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
NHLH2-201ENST00000320238 AAMPQ13685 434 aa24.45■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.44■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 TSPYL6Q8N831 410 aa24.43■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 MED14O60244 1454 aa24.43■■□□□ 1.5
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NHLH2-201ENST00000320238 IL16Q14005 1332 aa24.42■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.41■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.41■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 FAM83GA6ND36 823 aa24.4■■□□□ 1.5
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NHLH2-201ENST00000320238 DCTN1Q14203 1278 aa24.4■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.4■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 DIP2BQ9P265 1576 aa24.4■■□□□ 1.5
NHLH2-201ENST00000320238 SOX12O15370 315 aa24.38■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 IL13P35225 146 aa24.38■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 NFE2L2Q16236 605 aa24.38■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.38■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 COG3Q96JB2 828 aa24.37■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 ZMYM3Q14202 1370 aa24.37■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 KIF16BQ96L93 1317 aa24.36■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.36■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.36■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 LNPKQ9C0E8 428 aa24.36■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 GSE1Q14687 1217 aa24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 IL27Q8NEV9 243 aa24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 MBIPQ9NS73 344 aa24.35■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 VAMP4O75379 141 aa24.34■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.34■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.34■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.34■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 BECN1Q14457 450 aa24.33■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 ATP7BP35670 1465 aa24.33■■□□□ 1.49
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.32■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.32■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.32■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.31■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.31■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.31■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.31■■□□□ 1.48
NHLH2-201ENST00000320238 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
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