RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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RALGPS1-202ENST00000319107 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.15■■■□□ 2.1
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RALGPS1-202ENST00000319107 CABP1Q9NZU7 370 aa28.12■■■□□ 2.09
RALGPS1-202ENST00000319107 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.12■■■□□ 2.09
RALGPS1-202ENST00000319107 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
RALGPS1-202ENST00000319107 ACEP12821 1306 aa28.11■■■□□ 2.09
RALGPS1-202ENST00000319107 ADAMTS2O95450 1211 aa28.1■■■□□ 2.09
RALGPS1-202ENST00000319107 ALS2Q96Q42 1657 aa28.1■■■□□ 2.09
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RALGPS1-202ENST00000319107 USP21Q9UK80 565 aa28.07■■■□□ 2.08
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
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RALGPS1-202ENST00000319107 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.05■■■□□ 2.08
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RALGPS1-202ENST00000319107 A0A1W2PP64 1363 aa28.04■■■□□ 2.08
RALGPS1-202ENST00000319107 SBNO1A3KN83 1393 aa28.04■■■□□ 2.08
RALGPS1-202ENST00000319107 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.04■■■□□ 2.08
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RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC125Q86Z20 511 aa28■■■□□ 2.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28■■■□□ 2.07
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RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
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RALGPS1-202ENST00000319107 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.93■■■□□ 2.06
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RALGPS1-202ENST00000319107 USP19O94966 1318 aa27.8■■■□□ 2.04
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RALGPS1-202ENST00000319107 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.78■■■□□ 2.04
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
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RALGPS1-202ENST00000319107 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.78■■■□□ 2.04
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RALGPS1-202ENST00000319107 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.77■■■□□ 2.04
RALGPS1-202ENST00000319107 NLRP13Q86W25 1043 aa27.77■■■□□ 2.04
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RALGPS1-202ENST00000319107 NLRP6P59044 892 aa27.75■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 NFAT5O94916 1531 aa27.73■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.73■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 NSD2O96028 1365 aa27.73■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 FYB1O15117 783 aa27.72■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
RALGPS1-202ENST00000319107 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LTN1O94822 1766 aa27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.68■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 COG3Q96JB2 828 aa27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.65■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM83GA6ND36 823 aa27.65■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 GCP02774 474 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-202ENST00000319107 NRAPQ86VF7 1730 aa27.64■■■□□ 2.01
RALGPS1-202ENST00000319107 CPDO75976 1380 aa27.63■■■□□ 2.01
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
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