RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.46■■□□□ 1.19
PRKCI-201ENST00000295797 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.46■■□□□ 1.19
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM5Q9C035 493 aa22.46■■□□□ 1.19
PRKCI-201ENST00000295797 FIBPO43427 364 aa22.45■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SYNJ2O15056 1496 aa22.45■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM29Q14134 588 aa22.45■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 MARCH6O60337 910 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 PRAM1Q96QH2 718 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 ERC2O15083 957 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 MCM2P49736 904 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 PTPRKQ15262 1439 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 IGHDP01880 384 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SLC4A2P04920 1241 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 GNAI3P08754 354 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 RUFY1Q96T51 708 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 HMGXB3Q12766 1538 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SDF4Q9BRK5 362 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 CABP1Q9NZU7 370 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 AK7Q96M32 723 aa22.39■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.39■■□□□ 1.18
PRKCI-201ENST00000295797 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CNTROBQ8N137 903 aa22.38■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.38■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 UQCRHP07919 91 aa22.38■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 SPC24Q8NBT2 197 aa22.38■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.37■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 GNAI2P04899 355 aa22.37■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.35■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.34■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.34■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.34■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 H0YHG0 523 aa22.33■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CDK19Q9BWU1 502 aa22.33■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 TRDNQ13061 729 aa22.33■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.33■■□□□ 1.17
PRKCI-201ENST00000295797 CDR1P51861 262 aa22.33■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.33■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 FSD1Q9BTV5 496 aa22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 APPP05067 770 aa22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 PDILTQ8N807 584 aa22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.32■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.31■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 SYCE3A1L190 88 aa22.31■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.31■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 PSMA5P28066 241 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGEF11O15085 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 PDCP20941 246 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 SSFA2P28290 1259 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 OLFM4Q6UX06 510 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.3■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 KINO60870 393 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 NLRP6P59044 892 aa22.29■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 VPS53Q5VIR6 699 aa22.29■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.29■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.28■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 FCHSD2O94868 740 aa22.28■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM27P14373 513 aa22.28■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.27■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.27■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 SMC2O95347 1197 aa22.27■■□□□ 1.16
PRKCI-201ENST00000295797 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 C8orf34Q49A92 452 aa22.27■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC192P0DO97 292 aa22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CCP110O43303 1012 aa22.26■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF428Q96B54 188 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms