RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.83■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.82■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.8■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.79■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.79■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 TNNQ9UQP3 1299 aa35.77■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 STK26Q9P289 416 aa35.77■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 NLRP1Q9C000 1473 aa35.77■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.77■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 IL16Q14005 1332 aa35.76■■■■□ 3.32
UBP1-201ENST00000283628 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 GSE1Q14687 1217 aa35.74■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.74■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa35.72■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 TNRQ92752 1358 aa35.72■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 FYB1O15117 783 aa35.72■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 BECN1Q14457 450 aa35.71■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.71■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 PRAM1Q96QH2 718 aa35.71■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 SEC24BO95487 1268 aa35.7■■■■□ 3.31
UBP1-201ENST00000283628 POGKQ9P215 609 aa35.69■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.69■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 DLC1Q96QB1 1528 aa35.69■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.68■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.67■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.66■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.66■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
UBP1-201ENST00000283628 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.62■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 DDX19BQ9UMR2 479 aa35.62■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 TRIM27P14373 513 aa35.6■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D32Q96NH3 1257 aa35.6■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa35.59■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.59■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 CDK19Q9BWU1 502 aa35.58■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 RIPK4P57078 832 aa35.58■■■■□ 3.29
UBP1-201ENST00000283628 KIF16BQ96L93 1317 aa35.55■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 ATP7BP35670 1465 aa35.55■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 FCHSD2O94868 740 aa35.54■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.53■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.52■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 CABP1Q9NZU7 370 aa35.52■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.51■■■■□ 3.28
UBP1-201ENST00000283628 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.5■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.49■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.49■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 METP08581 1390 aa35.48■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 ZNF428Q96B54 188 aa35.48■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 C3P01024 1663 aa35.48■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.47■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 SMC5Q8IY18 1101 aa35.46■■■■□ 3.27
UBP1-201ENST00000283628 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.45■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa35.44■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 IL27Q8NEV9 243 aa35.44■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.44■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 TECPR2O15040 1411 aa35.43■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.43■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 TMEM57Q8N5G2 664 aa35.43■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 ANTXR1Q9H6X2 564 aa35.42■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 POLKQ9UBT6 870 aa35.41■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 CPS1P31327 1500 aa35.4■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 SIRT1Q96EB6 747 aa35.4■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D2Q9BYX2 928 aa35.39■■■■□ 3.26
UBP1-201ENST00000283628 PRKAR2BP31323 418 aa35.38■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.36■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.36■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 NFE2L2Q16236 605 aa35.34■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.255e-7■■■□□ 16.3
UBP1-201ENST00000283628 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 C22orf23Q9BZE7 217 aa35.33■■■■□ 3.25
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