RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264993.7

CDV3-201, Transcript of CDV3 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDV3, Length 3,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3-201ENST00000264993 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.95■■□□□ 1.59
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CDV3-201ENST00000264993 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.94■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.93■■□□□ 1.58
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CDV3-201ENST00000264993 RUNDC1Q96C34 613 aa24.93■■□□□ 1.58
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CDV3-201ENST00000264993 ADGRL1O94910 1474 aa24.91■■□□□ 1.58
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CDV3-201ENST00000264993 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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CDV3-201ENST00000264993 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.85■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.85■■□□□ 1.57
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CDV3-201ENST00000264993 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.83■■□□□ 1.57
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CDV3-201ENST00000264993 CFAP53Q96M91 514 aa24.82■■□□□ 1.56
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CDV3-201ENST00000264993 FBLN1P23142 703 aa24.79■■□□□ 1.56
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CDV3-201ENST00000264993 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 VGLL3A8MV65 326 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.77■■□□□ 1.56
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CDV3-201ENST00000264993 E9PCH4 1651 aa24.75■■□□□ 1.55
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CDV3-201ENST00000264993 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.74■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SNX21Q969T3 373 aa24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 USP25Q9UHP3 1055 aa24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 ZBTB22O15209 634 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 DDIT3P35638 169 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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CDV3-201ENST00000264993 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 MAP7D2Q96T17 732 aa24.72■■□□□ 1.55
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CDV3-201ENST00000264993 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 PLA2R1Q13018 1463 aa24.7■■□□□ 1.54
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CDV3-201ENST00000264993 WDR63Q8IWG1 891 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 STK26Q9P289 416 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 DYNC1I1O14576 645 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 PIK3C2GO75747 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ABCA6Q8N139 1617 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ATP2B3Q16720 1220 aa24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 HMOX1P09601 288 aa24.65■■□□□ 1.54
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