RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264993.7

CDV3-201, Transcript of CDV3 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDV3, Length 3,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3-201ENST00000264993 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.95■■□□□ 1.59
CDV3-201ENST00000264993 CDCA8Q53HL2 280 aa24.95■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 DTNBO60941 627 aa24.94■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.94■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.93■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.93■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 RUNDC1Q96C34 613 aa24.93■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.92■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 ADGRL1O94910 1474 aa24.91■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 PLXNC1O60486 1568 aa24.91■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 RICTORQ6R327 1708 aa24.9■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.9■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CDV3-201ENST00000264993 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.88■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 A2MP01023 1474 aa24.88■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 TSPOAP1O95153 1857 aa24.87■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.86■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 AK9Q5TCS8 1911 aa24.86■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.86■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.86■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 SMC5Q8IY18 1101 aa24.86■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 INSRP06213 1382 aa24.85■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.85■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.85■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 AAMPQ13685 434 aa24.85■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.84■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.84■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.83■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.83■■□□□ 1.57
CDV3-201ENST00000264993 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.83■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.82■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.82■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 CFAP53Q96M91 514 aa24.82■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.81■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 KIF2CQ99661 725 aa24.79■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 FBLN1P23142 703 aa24.79■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 VGLL3A8MV65 326 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.78■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.77■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.77■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 ATP7AQ04656 1500 aa24.77■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.77■■□□□ 1.56
CDV3-201ENST00000264993 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.76■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 GPT2Q8TD30 523 aa24.76■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 E9PCH4 1651 aa24.75■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.75■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 KIF16BQ96L93 1317 aa24.74■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.74■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SNX21Q969T3 373 aa24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 USP25Q9UHP3 1055 aa24.73■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 ZBTB22O15209 634 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 DDIT3P35638 169 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 MAP7D2Q96T17 732 aa24.72■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.552e-12■■■□□ 16.5
CDV3-201ENST00000264993 NUCB1Q02818 461 aa24.71■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.71■■□□□ 1.55
CDV3-201ENST00000264993 SPC24Q8NBT2 197 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 PLA2R1Q13018 1463 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.7■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.69■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 REREQ9P2R6 1566 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 WDR63Q8IWG1 891 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 STK26Q9P289 416 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 DYNC1I1O14576 645 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.68■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 PIK3C2GO75747 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ABCA6Q8N139 1617 aa24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 ATP2B3Q16720 1220 aa24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.66■■□□□ 1.54
CDV3-201ENST00000264993 HMOX1P09601 288 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms