RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.65■□□□□ 0.1
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HERC6-201ENST00000264346 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC6-201ENST00000264346 RILPL2Q969X0 211 aa15.64■□□□□ 0.09
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HERC6-201ENST00000264346 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
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HERC6-201ENST00000264346 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
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HERC6-201ENST00000264346 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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HERC6-201ENST00000264346 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.5■□□□□ 0.07
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HERC6-201ENST00000264346 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 ST18O60284 1047 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 CDC45O75419 566 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC6-201ENST00000264346 NSD2O96028 1365 aa15.46■□□□□ 0.07
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