RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.62■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 FCHSD2O94868 740 aa20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 HMOX1P09601 288 aa20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 ZFYVE9O95405 1425 aa20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.61■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 C14orf37Q86TY3 774 aa20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 ABCC11Q96J66 1382 aa20.59■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 SKAP1Q86WV1 359 aa20.59■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 KIF16BQ96L93 1317 aa20.59■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.59■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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CTCF-201ENST00000264010 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.58■□□□□ 0.89
CTCF-201ENST00000264010 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.58■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 GNAI1P63096 354 aa20.57■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 TNRQ92752 1358 aa20.55■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 GLI2P10070 1586 aa20.55■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 MROH2AA6NES4 1674 aa20.54■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 ZMYM3Q14202 1370 aa20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 NME9Q86XW9 330 aa20.52■□□□□ 0.88
CTCF-201ENST00000264010 IL16Q14005 1332 aa20.51■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 NFE2L2Q16236 605 aa20.51■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 SLC4A3P48751 1232 aa20.51■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.51■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.5■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 ADGRB1O14514 1584 aa20.5■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 AMPHP49418 695 aa20.49■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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CTCF-201ENST00000264010 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.49■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.49■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.48■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.48■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 ZNF428Q96B54 188 aa20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 POLKQ9UBT6 870 aa20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 IGHDP01880 384 aa20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 PPLO60437 1756 aa20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.46■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTCF-201ENST00000264010 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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CTCF-201ENST00000264010 TSPOAP1O95153 1857 aa20.45■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 USP35Q9P2H5 1018 aa20.45■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 FBLN1P23142 703 aa20.45■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.44■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.43■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHG5O94827 1062 aa20.42■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.42■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.41■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 PIK3C2BO00750 1634 aa20.41■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 MYOM1P52179 1685 aa20.41■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 TRIM27P14373 513 aa20.4■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 RLBP1P12271 317 aa20.4■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 IFT57Q9NWB7 429 aa20.39■□□□□ 0.86
CTCF-201ENST00000264010 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 SIRT1Q96EB6 747 aa20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.39■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.38■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 ALKQ9UM73 1620 aa20.38■□□□□ 0.85
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CTCF-201ENST00000264010 GSE1Q14687 1217 aa20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 IFT172Q9UG01 1749 aa20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.37■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.36■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 ACEP12821 1306 aa20.36■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 STK31Q9BXU1 1019 aa20.35■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 NLRP6P59044 892 aa20.35■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.35■□□□□ 0.85
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