RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 SKAP1Q86WV1 359 aa26.2■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.18■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.17■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.17■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 NSD2O96028 1365 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 KCNA6P17658 529 aa26.13■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 FBLN1P23142 703 aa26.11■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 ATP7BP35670 1465 aa26.11■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 APAF1O14727 1248 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 FAM161AQ3B820 660 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 NFKBIBQ15653 356 aa26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 NME9Q86XW9 330 aa26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 DIP2AQ14689 1571 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 GSE1Q14687 1217 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 PTCH1Q13635 1447 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 CFAP53Q96M91 514 aa26.04■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 GOLGA2Q08379 1002 aa26.03■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ADGRB2O60241 1585 aa26.02■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 SLC4A3P48751 1232 aa26.02■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZNF521Q96K83 1311 aa26.01■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 SHPRHQ149N8 1683 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ACEP12821 1306 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 C8orf34Q49A92 452 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.99■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PIK3R4Q99570 1358 aa25.98■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.98■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 NEUROD2Q15784 382 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 POLKQ9UBT6 870 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 SLFN5Q08AF3 891 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RGS3P49796 1198 aa25.93■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RUNDC1Q96C34 613 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 COG3Q96JB2 828 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 AKAP12Q02952 1782 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 ITSN1Q15811 1721 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 USP6P35125 1406 aa25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.87■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 WWC1Q8IX03 1113 aa25.85■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 HSPA2P54652 639 aa25.83■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 SOX12O15370 315 aa25.83■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 E9PSI1 815 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 C14orf37Q86TY3 774 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 SSH2Q76I76 1423 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 BCAR3O75815 825 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.78■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NGEFQ8N5V2 710 aa25.78■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.77■■□□□ 1.72
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