RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233121.6

MAPRE3-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE3, Length 1,892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3-201ENST00000233121 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.8■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.8■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 ITSN1Q15811 1721 aa23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3-201ENST00000233121 AKAP12Q02952 1782 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 BCAR3O75815 825 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 SLIT1O75093 1534 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 MS4A1P11836 297 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 PDE3AQ14432 1141 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 EID1Q9Y6B2 187 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.72■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 LTKP29376 864 aa23.72■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.71■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.71■■□□□ 1.39
MAPRE3-201ENST00000233121 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 POLKQ9UBT6 870 aa23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 FCHSD2O94868 740 aa23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 NME9Q86XW9 330 aa23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 IL16Q14005 1332 aa23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 MSH5O43196 834 aa23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 DIP2AQ14689 1571 aa23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.64■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 COG3Q96JB2 828 aa23.64■■□□□ 1.38
MAPRE3-201ENST00000233121 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.64■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 NEFMP07197 916 aa23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 TBX22Q9Y458 520 aa23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 PTPRUQ92729 1446 aa23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 RIPK4P57078 832 aa23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 AAMPQ13685 434 aa23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 PTCH1Q13635 1447 aa23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 PDE4AP27815 886 aa23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.58■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.58■■□□□ 1.37
MAPRE3-201ENST00000233121 FBLN1P23142 703 aa23.58■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 PRKAR2BP31323 418 aa23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 PANK1Q8TE04 598 aa23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 BACH2Q9BYV9 841 aa23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 IL13P35225 146 aa23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 COG6Q9Y2V7 657 aa23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 ACEP12821 1306 aa23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 USP6P35125 1406 aa23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 NFE2L2Q16236 605 aa23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3-201ENST00000233121 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 HMOX1P09601 288 aa23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 PIK3R4Q99570 1358 aa23.48■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.48■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 SKAP1Q86WV1 359 aa23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 NUTM2FA1L443 756 aa23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 RLBP1P12271 317 aa23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3-201ENST00000233121 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms