RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 NEUROD1Q13562 356 aa24.8■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.79■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 MIER1Q8N108 512 aa24.77■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.76■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.76■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.75■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 ITSN1Q15811 1721 aa24.75■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 C8orf37Q96NL8 207 aa24.74■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 AFF2P51816 1311 aa24.74■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.74■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS2O95450 1211 aa24.73■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 PSME1Q06323 249 aa24.73■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.72■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.71■■□□□ 1.55
PLGRKT-201ENST00000223864 NGLY1Q96IV0 654 aa24.7■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.69■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 SBNO1A3KN83 1393 aa24.68■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.68■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP7BP35670 1465 aa24.67■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.67■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 CDK19Q9BWU1 502 aa24.67■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 RXRBP28702 533 aa24.65■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PLGRKT-201ENST00000223864 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.64■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.64■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF10O15013 1369 aa24.63■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ALS2Q96Q42 1657 aa24.62■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA3Q99758 1704 aa24.62■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.61■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TONSLQ96HA7 1378 aa24.61■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.6■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 USP21Q9UK80 565 aa24.6■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.59■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.56■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.55■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.54■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ACEP12821 1306 aa24.53■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ATRNO75882 1429 aa24.52■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.52■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHG5O94827 1062 aa24.52■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CABP2Q9NPB3 220 aa24.52■■□□□ 1.52
PLGRKT-201ENST00000223864 SLIT2O94813 1529 aa24.51■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.51■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.51■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.51■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 EVC2Q86UK5 1308 aa24.5■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.5■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RGS12O14924 1447 aa24.48■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.48■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.47■■□□□ 1.51
PLGRKT-201ENST00000223864 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.43■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM83GA6ND36 823 aa24.43■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CABP1Q9NZU7 370 aa24.43■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.41■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 GLI3P10071 1580 aa24.4■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 NRAPQ86VF7 1730 aa24.4■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 AKAP12Q02952 1782 aa24.39■■□□□ 1.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ABTB2Q8N961 1025 aa24.39■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.38■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 USP6P35125 1406 aa24.37■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 EVX2Q03828 476 aa24.37■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 VPS72Q15906 364 aa24.37■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.37■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.36■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 BTG4Q9NY30 223 aa24.35■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.34■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.33■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP13Q86W25 1043 aa24.33■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.33■■□□□ 1.49
PLGRKT-201ENST00000223864 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.33■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA0232Q92628 1395 aa24.32■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KLHL34Q8N239 644 aa24.32■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SSH2Q76I76 1423 aa24.32■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 USP19O94966 1318 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms