RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.28■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.28■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.28■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 RIPK4P57078 832 aa29.27■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.27■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.27■■■□□ 2.28
ERF-201ENST00000222329 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.25■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 NLRP1Q9C000 1473 aa29.24■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 HMOX1P09601 288 aa29.23■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 METP08581 1390 aa29.21■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.21■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.2■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 NME9Q86XW9 330 aa29.2■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 POLKQ9UBT6 870 aa29.2■■■□□ 2.27
ERF-201ENST00000222329 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.19■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.17■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 NUTM2FA1L443 756 aa29.17■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 PRKAR2BP31323 418 aa29.17■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.16■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 ZMYM3Q14202 1370 aa29.16■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.16■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 SEC24BO95487 1268 aa29.15■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.15■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 ADGRB2O60241 1585 aa29.14■■■□□ 2.26
ERF-201ENST00000222329 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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ERF-201ENST00000222329 NEFMP07197 916 aa29.12■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 AGLP35573 1532 aa29.12■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 TRIM27P14373 513 aa29.11■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.1■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.1■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.1■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.09■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.09■■■□□ 2.25
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ERF-201ENST00000222329 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.08■■■□□ 2.25
ERF-201ENST00000222329 MED14O60244 1454 aa29.07■■■□□ 2.24
ERF-201ENST00000222329 FCHSD2O94868 740 aa29.07■■■□□ 2.24
ERF-201ENST00000222329 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.06■■■□□ 2.24
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ERF-201ENST00000222329 COG3Q96JB2 828 aa29■■■□□ 2.23
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ERF-201ENST00000222329 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.99■■■□□ 2.23
ERF-201ENST00000222329 IL13P35225 146 aa28.99■■■□□ 2.23
ERF-201ENST00000222329 ATP7BP35670 1465 aa28.99■■■□□ 2.23
ERF-201ENST00000222329 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.98■■■□□ 2.23
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ERF-201ENST00000222329 FAM83GA6ND36 823 aa28.97■■■□□ 2.23
ERF-201ENST00000222329 TNRQ92752 1358 aa28.97■■■□□ 2.23
ERF-201ENST00000222329 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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ERF-201ENST00000222329 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.92■■■□□ 2.22
ERF-201ENST00000222329 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.9■■■□□ 2.22
ERF-201ENST00000222329 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.89■■■□□ 2.22
ERF-201ENST00000222329 MBIPQ9NS73 344 aa28.89■■■□□ 2.22
ERF-201ENST00000222329 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.87■■■□□ 2.21
ERF-201ENST00000222329 VAMP4O75379 141 aa28.87■■■□□ 2.21
ERF-201ENST00000222329 NFKBIBQ15653 356 aa28.87■■■□□ 2.21
ERF-201ENST00000222329 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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