RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.35■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.34■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSPOAP1O95153 1857 aa28.34■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.34■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CABP1Q9NZU7 370 aa28.33■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.33■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TNNQ9UQP3 1299 aa28.33■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP35Q9P2H5 1018 aa28.31■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IL16Q14005 1332 aa28.3■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.3■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.3■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BCL11AQ9H165 835 aa28.3■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP7BP35670 1465 aa28.27■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.27■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEFMP07197 916 aa28.25■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.25■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.25■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZMYM3Q14202 1370 aa28.23■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIPK4P57078 832 aa28.23■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FCHSD2O94868 740 aa28.22■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.2■■■□□ 2.11
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC4A3P48751 1232 aa28.19■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP19O94966 1318 aa28.19■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLKQ9UBT6 870 aa28.19■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.18■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.18■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.17■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.16■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM27P14373 513 aa28.15■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MLECQ14165 292 aa28.15■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.15■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.14■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.14■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 METP08581 1390 aa28.12■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SEC24BO95487 1268 aa28.12■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.11■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRKAR2BP31323 418 aa28.11■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.11■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FBLN1P23142 703 aa28.1■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SIRT1Q96EB6 747 aa28.1■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.08■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF16BQ96L93 1317 aa28.08■■■□□ 2.09
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TECPR2O15040 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NFKBIBQ15653 356 aa28.06■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NFE2L2Q16236 605 aa28.06■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.06■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF428Q96B54 188 aa28.05■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IL13P35225 146 aa28.04■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NME9Q86XW9 330 aa28.04■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.03■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.02■■■□□ 2.08
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CPS1P31327 1500 aa28.01■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HMOX1P09601 288 aa28■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.99■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.99■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AKAP12Q02952 1782 aa27.99■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SMC5Q8IY18 1101 aa27.98■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TNRQ92752 1358 aa27.98■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COG3Q96JB2 828 aa27.98■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.97■■■□□ 2.07
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BECN1Q14457 450 aa27.96■■■□□ 2.07
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