RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.54■■□□□ 1.52
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SIKE1-201ENST00000060969 AKAP12Q02952 1782 aa24.54■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 PTCH1Q13635 1447 aa24.53■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
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SIKE1-201ENST00000060969 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.52■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 NEUROD2Q15784 382 aa24.51■■□□□ 1.51
SIKE1-201ENST00000060969 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.5■■□□□ 1.51
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SIKE1-201ENST00000060969 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.46■■□□□ 1.51
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SIKE1-201ENST00000060969 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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SIKE1-201ENST00000060969 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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SIKE1-201ENST00000060969 PIK3R4Q99570 1358 aa24.41■■□□□ 1.5
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SIKE1-201ENST00000060969 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SIKE1-201ENST00000060969 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.4■■□□□ 1.5
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SIKE1-201ENST00000060969 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SIKE1-201ENST00000060969 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.36■■□□□ 1.49
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SIKE1-201ENST00000060969 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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SIKE1-201ENST00000060969 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.32■■□□□ 1.48
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SIKE1-201ENST00000060969 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.32■■□□□ 1.48
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SIKE1-201ENST00000060969 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.29■■□□□ 1.48
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SIKE1-201ENST00000060969 PRKAR2BP31323 418 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-201ENST00000060969 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.27■■□□□ 1.48
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SIKE1-201ENST00000060969 PIK3C2AO00443 1686 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-201ENST00000060969 PEAK1Q9H792 1746 aa24.23■■□□□ 1.47
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SIKE1-201ENST00000060969 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.19■■□□□ 1.46
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SIKE1-201ENST00000060969 C14orf37Q86TY3 774 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 NEFMP07197 916 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 NLRP6P59044 892 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SIKE1-201ENST00000060969 NFE2L2Q16236 605 aa24.14■■□□□ 1.45
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