RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa12.2□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc3B2RX12 1523 aa12.2□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mink1Q9JM52 1308 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dph2Q9CR25 489 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SphkapQ6NSW3 1687 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adcy10Q8C0T9 1614 aa12.18□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa12.17□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa12.17□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Peg3Q3URU2 1571 aa12.17□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif3bQ61771 747 aa12.16□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa12.16□□□□□ -0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cfap65Q3V0B4 1847 aa12.14□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map2k5Q9WVS7 448 aa12.14□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Myom2Q14BI5 1463 aa12.14□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Uri1Q3TLD5 531 aa12.13□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k9Q3U1V8 1077 aa12.13□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Erbb4Q61527 1308 aa12.11□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Naip6Q9JIB6 1403 aa12.11□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Talpid3E9PV87 1520 aa12.11□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gli2Q0VGT2 1544 aa12.11□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gpr37Q9QY42 600 aa12.11□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa12.1□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nos2P29477 1144 aa12.1□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tsen34Q8BMZ5 316 aa12.1□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abca6Q8K441 1624 aa12.1□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nos1Q9Z0J4 1429 aa12.1□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mtus2Q3UHD3 1353 aa12.09□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hecw1Q8K4P8 1604 aa12.09□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp8b1O88962 500 aa12.09□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trpm2Q91YD4 1506 aa12.09□□□□□ -0.47
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dip2aQ8BWT5 1523 aa12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Art1Q60935 325 aa12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sulf1Q8K007 870 aa12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chic2Q9D9G3 165 aa12.07□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cops2P61202 443 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scube3Q66PY1 993 aa12.06□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam117aQ7TNF9 451 aa12.06□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa12.06□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scn4aQ9ER60 1841 aa12.05□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MsmpB1AWI6 139 aa12.04□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cabp1Q9JLK7 227 aa12.04□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fhod3Q76LL6 1578 aa12.03□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cul9Q80TT8 1865 aa12.03□□□□□ -0.48
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dip2bQ3UH60 1574 aa12.02□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k14Q9WUL6 942 aa12.02□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc5Q9R1X5 1436 aa12.02□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plekhh2Q8C115 1491 aa12.02□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Topaz1E5FYH1 1653 aa12.01□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GopcQ8BH60 463 aa12.01□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Naip5Q9R016 1403 aa12.01□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trpm1Q2TV84 1622 aa11.99□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ncoa1P70365 1447 aa11.98□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fmn2Q9JL04 1578 aa11.97□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bcl9Q9D219 1425 aa11.97□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hspa1lP16627 641 aa11.96□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Irf5P56477 497 aa11.96□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sp7Q8VI67 428 aa11.96□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmem52Q9D702 196 aa11.96□□□□□ -0.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Knl1Q66JQ7 1612 aa11.96□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa11.95□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc4a9E9PUP3 929 aa11.95□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rapgef3Q8VCC8 918 aa11.95□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phox2bO35690 314 aa11.93□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 OatP29758 439 aa11.93□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dbn1Q9QXS6 706 aa11.93□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plch2A2AP18 1501 aa11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NclP09405 707 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ggt6Q6PDE7 497 aa11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hfm1D3Z4R1 1434 aa11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ssh2Q5SW75 1423 aa11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mast1Q9R1L5 1570 aa11.92□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Il16O54824 1322 aa11.91□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc6Q9R1S7 1498 aa11.91□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtpreP49446 699 aa11.91□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Uggt2E9Q4X2 1504 aa11.91□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa11.9□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RictorQ6QI06 1708 aa11.9□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa11.9□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa11.9□□□□□ -0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa11.89□□□□□ -0.51
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Txndc2Q6P902 515 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.8 ms