RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC5A3	P53794	718 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CASP9	P55211	416 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ANTXR2	P58335	489 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ELP6	Q0PNE2	266 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DOC2A	Q14183	400 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	UGT8	Q16880	541 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KLC3	Q6P597	504 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HOOK3	Q86VS8	718 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BANP	Q8N9N5	519 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	WASF1	Q92558	559 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM162A	Q96A26	154 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MAP7D2	Q96T17	732 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	APPL1	Q9UKG1	709 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PSME2	Q9UL46	239 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MED16	Q9Y2X0	877 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340		H0YIV9	168 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KCNK3	O14649	394 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PPEF2	O14830	753 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SPOP	O43791	374 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RECQL4	O94761	1208 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RB1	P06400	928 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ANXA6	P08133	673 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RARA	P10276	462 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CYP2D6	P10635	497 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BCR	P11274	1271 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	UBL4A	P11441	157 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FGFR3	P22607	806 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BTD	P43251	543 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HSD17B4	P51659	736 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	USP11	P51784	963 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BCAR1	P56945	870 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PLD1	Q13393	1074 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF174	Q15697	407 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CORO6	Q6QEF8	472 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340		Q6ZUG5	572 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HDX	Q7Z353	690 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	P3H2	Q8IVL5	708 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	NEK11	Q8NG66	645 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HASPIN	Q8TF76	798 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	NRG4	Q8WWG1	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SNX22	Q96L94	193 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TEX12	Q9BXU0	123 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340		H3BUI4	141 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	EBAG9	O00559	213 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CDKL5	O76039	1030 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DLGAP3	O95886	979 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PRKCB	P05771	671 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GLI1	P08151	1106 aa		7.21	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25

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