RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PTP4A2Q12974 167 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MTM1Q13496 603 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 POU6F1Q14863 301 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DUPD1Q68J44 220 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CYGBQ8WWM9 190 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 IRGQQ8WZA9 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CNDP1Q96KN2 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF558Q96NG5 402 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PDP2Q9P2J9 529 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HAO1Q9UJM8 370 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ALS2Q96Q42 1657 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 E7ENQ6 273 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 EPHB6O15197 1021 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BCL2L1Q07817 233 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMC7Q7Z402 723 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KAT5Q92993 513 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RGPD5Q99666 1765 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WNT7AO00755 349 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 UBDO15205 165 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PMM2O15305 246 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DGKIO75912 1065 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN3P26045 913 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FBXW4P57775 412 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMED1Q13445 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 STRADAQ7RTN6 431 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM199Q8N511 208 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SGF29Q96ES7 293 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FKTNO75072 461 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KRT6AP02538 564 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KRT6BP04259 564 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CSH1P0DML2 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CSH2P0DML3 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RAG1P15918 1043 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KRT6CP48668 564 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NOGQ13253 232 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NFYCQ13952 458 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SGO1Q5FBB7 561 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 USP45Q70EL2 814 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF398Q8TD17 642 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 A0A096LPK6 155 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VGLL3A8MV65 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCNE2O96020 404 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GLRBP48167 497 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BMPR2Q13873 1038 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HECTD3Q5T447 861 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM69Q86WT6 500 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AHSPQ9NZD4 102 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GLTPD2A6NH11 291 aa6.59□□□□□ -1.35
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