RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTPN3P26045 913 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TYK2P29597 1187 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERPINB8P50452 374 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIMK2P53671 638 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 LILRA4P59901 499 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 IRX4P78413 519 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRADDP78560 199 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDE1BQ01064 536 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 KDSRQ06136 332 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTKQ06187 659 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRIK3Q13003 919 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX17Q15036 470 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GSTA3Q16772 222 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCAF6Q58WW2 860 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PID1Q7Z2X4 250 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAVSQ7Z434 540 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLEC14AQ86T13 490 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM135Q86UB9 458 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCLK2Q8N568 766 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PGBD4Q96DM1 585 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TINF2Q9BSI4 451 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF39Q9H2S5 420 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX15Q9NRS6 342 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 KRT82Q9NSB4 513 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PNPOQ9NVS9 261 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RRN3Q9NYV6 651 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 BFARQ9NZS9 450 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPPA5A6NC42 116 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTBD19C9JJ37 291 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 AP3B1O00203 1094 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 BEST1O76090 585 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 USP1O94782 785 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 FYNP06241 537 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERVK-10P10266 1014 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERCC2P18074 760 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNA4P22459 653 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAJB2P25686 324 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC25CP30307 473 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MLH1P40692 756 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 HADHAP40939 763 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 NUMBP49757 651 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSEN2P49810 448 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDUFV1P49821 464 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSRP3P50461 194 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKAA2P54646 552 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SESN3P58005 492 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DAOAP59103 153 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 AP2B1P63010 937 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GALNT2Q10471 571 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RCN2Q14257 317 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFSD10Q14728 455 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPM1JQ5JR12 505 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB41Q5JT25 222 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR142Q7Z601 462 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPP9Q86TI2 863 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCNYQ8ND76 341 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 HDAC11Q96DB2 347 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPDL1Q96EA4 605 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSGA13Q96PP4 275 aa9.84□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms