RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPN9O14815 690 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 HPDP32754 393 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 LSP1P33241 339 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TIE1P35590 1138 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 NME3Q13232 169 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PM20D1Q6GTS8 502 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM7AQ6ZMT4 941 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CPA6Q8N4T0 437 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF9Q9HAQ2 790 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PNPLA8Q9NP80 782 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SUN2Q9UH99 717 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM59LQ9UK28 342 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 WASH3PC4AMC7 463 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ADH5P11766 374 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP3CCP48454 512 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP52Q8N1V2 620 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 EMC1Q8N766 993 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2W6PQ8NHA6 318 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 EPS8L1Q8TE68 723 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HHIPQ96QV1 700 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 OBP2AQ9NY56 170 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1257Q9ULG3 409 aa12.96□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CPP00450 1065 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ECHS1P30084 290 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FLT3P36888 993 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE6CP51160 858 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CCINQ13939 588 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PDGFRLQ15198 375 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX30Q5VWJ9 437 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHB18PQ96TA0 734 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOX2Q99424 681 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 STK33Q9BYT3 514 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3BA6NDS4 549 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 LAMTOR5O43504 91 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MED7O43513 233 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TULP3O75386 442 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NFATC1O95644 943 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TYRP14679 529 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC24CP53992 1094 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TAC4Q86UU9 113 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF366Q8N895 744 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ISCUQ9H1K1 167 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CNGB3Q9NQW8 809 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SPHK2Q9NRA0 654 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 IGSF5Q9NSI5 407 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX10Q9Y5X0 201 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ASPMQ8IZT6 3477 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PATJQ8NI35 1801 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 A6NNZ2 444 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MAN2B1O00754 1011 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNB2P17787 502 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB106AQ8N104 65 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ALLCQ8N6M5 410 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DDI1Q8WTU0 396 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD13Q8WZ19 329 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NEUROG2Q9H2A3 272 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SOX5P35711 763 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B3P37058 310 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf76Q5T2E6 689 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXW10Q5XX13 1052 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX26Q7Z412 305 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CD101Q93033 1021 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms