RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	MIS12	Q9H081	205 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SCML1	Q9UN30	329 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ASL	P04424	464 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	VAV1	P15498	845 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ACADVL	P49748	655 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ADPRH	P54922	357 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ST8SIA6	P61647	398 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2CB	P62714	309 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2CA	P67775	309 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CNGA2	Q16280	664 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	INAVA	Q3KP66	663 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF6	Q58WW2	860 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	STK40	Q8N2I9	435 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TSG101	Q99816	390 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	FZD4	Q9ULV1	537 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ENC1	O14682	589 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO21	O94952	628 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CD38	P28907	300 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC8A1	P32418	973 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	DRD3	P35462	400 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC63	Q05C16	580 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NNT	Q13423	1086 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RRAGA	Q7L523	313 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LGI2	Q8N0V4	545 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	KDM1B	Q8NB78	822 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	OMD	Q99983	421 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	MGA	Q8IWI9	3026 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LAT	O43561	262 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	DFNA5	O60443	496 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	RFPL3	O75679	317 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB4	P21439	1286 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TACR2	P21452	398 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ITPKB	P27987	946 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	GPD2	P43304	727 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR5	P51681	352 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NXPH1	P58417	271 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ECT2L	Q008S8	904 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	STIL	Q15468	1287 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CHSY1	Q86X52	802 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	EID2	Q8N6I1	236 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TSC1	Q92574	1164 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-233	ENST00000602338	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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