RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ACADSB	P45954	432 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PSMD8	P48556	350 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ST8SIA6	P61647	398 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	E2F5	Q15329	346 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SHC3	Q92529	594 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MED7	O43513	233 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CER1	O95813	267 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ASL	P04424	464 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ERBB2	P04626	1255 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C7	P10643	843 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PON1	P27169	355 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CST6	Q15828	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PTPRB	P23467	1997 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		F5H5T6	163 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		H0Y8X5	98 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	WNT9A	O14904	365 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CD27	P26842	260 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GALC	P54803	685 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ECT2L	Q008S8	904 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MEA1	Q16626	185 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM129B	Q96TA1	746 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	LAMA5	O15230	3695 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	WNT1	P04628	370 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC8A1	P32418	973 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CLCN1	P35523	988 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GRIA4	P48058	902 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	UBE2H	P62256	183 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP2CB	P62714	309 aa		13.3	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms