RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 EMC1Q8N766 993 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NPY6RQ99463 290 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NACA2Q9H009 215 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 KCND1Q9NSA2 647 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND4CQ5VZ89 1909 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 MAN1A1P33908 653 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PGFP49763 221 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 MTA1Q13330 715 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO7Q6IWH7 933 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 STRADAQ7RTN6 431 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 HDDC3Q8N4P3 179 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CD101Q93033 1021 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TDP1Q9NUW8 608 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 COCHO43405 550 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GJB6O95452 261 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV3-25P01717 112 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 HDCP19113 662 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMA2P25787 234 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DPP6P42658 865 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SULT1E1P49888 294 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM193AP78312 1265 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC7A9P82251 487 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNDC8Q6A555 127 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM32Q8TC27 787 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM74BQ9NUR3 256 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf78A6NCI8 922 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ENDOD1O94919 500 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 COG7P83436 770 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC14Q49A88 953 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TRNP1Q6NT89 227 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 BNIPLQ7Z465 357 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CPA6Q8N4T0 437 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ECT2Q9H8V3 914 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 IRAK2O43187 625 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF8O76064 485 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PROSCO94903 275 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CKMP06732 381 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 EFEMP1Q12805 493 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TAC4Q86UU9 113 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TFR2Q9UP52 801 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 M0QYT0 321 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K13O43283 966 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A3P11169 496 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TCF3P15923 654 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC1A1P43005 524 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGER3P43115 390 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 OGDHQ02218 1023 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RIN3Q8TB24 985 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 USP33Q8TEY7 942 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PLD4Q96BZ4 506 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TBCBQ99426 244 aa24.43■■□□□ 1.5
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