RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	ALG14	Q96F25	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934	COL4A2	P08572	1712 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-204	ENST00000589934		A0A1B0GVM2	712 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TBL1X	O60907	577 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CLDN11	O75508	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	FGG	P02679	453 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	BMP1	P13497	986 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GBE1	Q04446	702 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZP2	Q05996	745 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	KAZN	Q674X7	775 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MFSD11	O43934	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CACNG3	O60359	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TJP3	O95049	919 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	APOC2	P02655	101 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	IFNAR2	P48551	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TFDP2	Q14188	446 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	STIM2	Q9P246	746 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	APOL1	O14791	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ASGR2	P07307	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TYR	P14679	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TGM2	P21980	687 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GDI1	P31150	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NDST2	P52849	883 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PLK1	P53350	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GALNT2	Q10471	571 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RUNX3	Q13761	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms