RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589916.5

BCAS3-223, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 2

Gene BCAS3, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-223	ENST00000589916	CCDC130	P13994	396 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ITGB6	P18564	788 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	NDUFV2	P19404	249 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ABCB4	P21439	1286 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	LMO2	P25791	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CDC25C	P30307	473 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	HNF1B	P35680	557 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	GRIK1	P39086	918 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	MAGEA11	P43364	429 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PLA2G4A	P47712	749 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	EPHB3	P54753	998 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ARPP19	P56211	112 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	NOMO3	P69849	1222 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	VAC14	Q08AM6	782 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	GPR17	Q13304	367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PDCL	Q13371	301 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ORC1	Q13415	861 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TAF12	Q16514	161 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	C2orf27A	Q580R0	203 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	GPR158	Q5T848	1215 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	FAM171B	Q6P995	826 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	FAM35A	Q86V20	835 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CPA6	Q8N4T0	437 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TRIM58	Q8NG06	486 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	RLN3	Q8WXF3	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TFAP2B	Q92481	460 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	MYLPF	Q96A32	169 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TWNK	Q96RR1	684 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	DESI2	Q9BSY9	194 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SYT11	Q9BT88	431 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	DUSP16	Q9BY84	665 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ISCU	Q9H1K1	167 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	KRT82	Q9NSB4	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TDP1	Q9NUW8	608 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PARVA	Q9NVD7	372 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	COMMD8	Q9NX08	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	YIPF1	Q9Y548	306 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	LRBA	P50851	2863 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	NF1	P21359	2839 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	FAM149A	A5PLN7	773 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916		K7ENP7	123 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	MYO1F	O00160	1098 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	PJA2	O43164	708 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ADAM23	O75077	832 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SFTPC	P11686	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	CHRNB2	P17787	502 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	MMP8	P22894	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	SCNN1A	P37088	669 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	OPRD1	P41143	372 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	GRK6	P43250	576 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BCAS3-223	ENST00000589916	GPD2	P43304	727 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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