RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PJA2O43164 708 aa34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCZ1BP86790 482 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D31Q96DN5 1066 aa34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NEU3Q9UQ49 428 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF318Q5VUA4 2279 aa34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TEKT4Q8WW24 435 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 LACRTQ9GZZ8 138 aa34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa34.09■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR7P34969 479 aa34.08■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CA9Q16790 459 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMTNL2Q2TAL5 461 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNT1Q5JUK3 1230 aa34.08■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM215Q68D42 235 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRG1Q9Y653 693 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM44O43615 452 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 RARAP10276 462 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOQP17081 205 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHB2P29323 1055 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC1A1P43005 524 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf27AQ580R0 203 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADIPOR2Q86V24 386 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE8Q86YQ8 564 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCMAQ8WVF2 138 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL2Q9NXB9 296 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF212Q9UDV6 495 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG13O75143 517 aa34.05■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MOCS3O95396 460 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIE1P35590 1138 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPI1P60174 286 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F5Q15329 346 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT11Q495W5 492 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ACDQ96AP0 544 aa34.04■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPKAPK2P49137 400 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUBP1P53384 320 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PITRM1Q5JRX3 1037 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKN3Q6P5Z2 889 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLNQ7Z5Q5 900 aa34.03■■■■□ 3.04
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