RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 NNMTP40261 264 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 APCDD1Q8J025 514 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 MYO19Q96H55 970 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 MRGPRX3Q96LB0 322 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 OMDQ99983 421 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 NDST4Q9H3R1 872 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 IL21RQ9HBE5 538 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SIX2Q9NPC8 291 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 FAM170AA1A519 330 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 IGLV3-25P01717 112 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PROS1P07225 676 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PDGFRAP16234 1089 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 HLA-BQ31612 363 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 VWA3BQ502W6 1294 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 BIRC7Q96CA5 298 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SCML1Q9UN30 329 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CACNA1EQ15878 2313 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 MID1O15344 667 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 GJB3O75712 270 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 ERBB2P04626 1255 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PSMD8P48556 350 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 BPIFB4P59827 614 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 NUMA1Q14980 2115 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CST6Q15828 149 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TM7SF3Q9NS93 570 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 A0A1W2PP55 124 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM16O95361 564 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CLCN1P35523 988 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 STK19P49842 368 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLC6A3Q01959 620 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 USP30Q70CQ3 517 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 KDM1BQ8NB78 822 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 TM9SF3Q9HD45 589 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 VANGL2Q9ULK5 521 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 WASF3Q9UPY6 502 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 USP24Q9UPU5 2620 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PCNX2A6NKB5 2137 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 A0A1B0GVM2 712 aa26.14■■□□□ 1.78
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PPP4C-208ENST00000564966 TCAF2A6NFQ2 919 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 M0QYT0 321 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 DAB1O75553 588 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CD27P26842 260 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SLC12A1Q13621 1099 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 C9orf64Q5T6V5 341 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 FBXL22Q6P050 247 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 STK40Q8N2I9 435 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 SIK2Q9H0K1 926 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 KLK13Q9UKR3 277 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-208ENST00000564966 LRRC72A6NJI9 287 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 IL1BP01584 269 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 SLC8A1P32418 973 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 GGCXP38435 758 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 OXCT1P55809 520 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 BNC1Q01954 994 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 CENPCQ03188 943 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 SULT2A1Q06520 285 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 KCNJ12Q14500 433 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 KIF19Q2TAC6 998 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 ACCSLQ4AC99 568 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 TAF3Q5VWG9 929 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA0895LQ68EN5 471 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 LAYNQ6UX15 382 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 C1orf216Q8TAB5 229 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 SERGEFQ9UGK8 458 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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