RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562040.1

AC135782.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC135782.2, Length 472 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC135782.2-201ENST00000562040 GABRG3Q99928 467 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 HCN2Q9UL51 889 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.5□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 I6L893 689 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RNF8O76064 485 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ASLP04424 464 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ST8SIA6P61647 398 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SULT2A1Q06520 285 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ZNF234Q14588 700 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 FUT11Q495W5 492 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 EFHC2Q5JST6 749 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PGBD3Q8N328 593 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 HMGB4Q8WW32 186 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TTC17Q96AE7 1141 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 LMLNQ96KR4 655 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 THAP2Q9H0W7 228 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RAB23Q9ULC3 237 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.49□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 DRGXA6NNA5 263 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 WASH3PC4AMC7 463 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CSKP41240 450 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 IL12RB1P42701 662 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 OGDHQ02218 1023 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SCAPQ12770 1279 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RAB6CQ53S08 254 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CEP68Q76N32 757 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RASSF3Q86WH2 238 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CCDC185Q8N715 623 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PHOX2BQ99453 314 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 MUC3BQ9H195 1237 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.48□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 A0A1W2PQF6 199 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PRPSAP2O60256 369 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CNTN5O94779 1100 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CYP1A2P05177 515 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 EPHX1P07099 455 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RHOCP08134 193 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 OR1E1P30953 314 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 HOXC13P31276 330 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 NNMTP40261 264 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 IRAK1P51617 712 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PLK1P53350 603 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 GALCP54803 685 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ECT2LQ008S8 904 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ENPP2Q13822 863 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ACAP1Q15027 740 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 ALFQ53S48 1182 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 GAB3Q8WWW8 586 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SPACA7Q96KW9 195 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 NUP85Q9BW27 656 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 EPC1Q9H2F5 836 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 MPP6Q9NZW5 540 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SUN2Q9UH99 717 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 VPS28Q9UK41 221 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 RAD54BQ9Y620 910 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.47□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 HRO43593 1189 aa14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 H2AFZP0C0S5 128 aa14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PRKCHP24723 683 aa14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 L1CAMP32004 1257 aa14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 KRT83P78385 493 aa14.46□□□□□ -0.09
AC135782.2-201ENST00000562040 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms