RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 MID2Q9UJV3 735 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 LTBP2Q14767 1821 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MGAMO43451 1857 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 H7C1Q1 480 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PPP6CO00743 305 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PIAS2O75928 621 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PRR35P0CG20 571 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 IL1R1P14778 569 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CAPN2P17655 700 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TPH1P17752 444 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KELP23276 732 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CERS1P27544 350 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CPT1AP50416 773 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TIRAPP58753 221 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PSG6Q00889 435 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 STK3Q13188 491 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MTX3Q5HYI7 312 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 BADQ92934 168 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TIFAQ96CG3 184 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DKK4Q9UBT3 224 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.66□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TUBB4AP04350 444 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CREB1P16220 341 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KLRK1P26718 216 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ACVR2AP27037 513 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RENBPP51606 427 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PGDP52209 483 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ERO1BQ86YB8 467 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CERS3Q8IU89 383 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CERS5Q8N5B7 392 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RITA1Q96K30 269 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 C5orf34Q96MH7 638 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 APOL5Q9BWW9 433 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.65□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.65□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.65□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 MYO9BQ13459 2157 aa5.65□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 AQP7P3A6NL99 342 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 INMTO95050 263 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 MT-ND5P03915 603 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF81P51508 661 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 PPIL2Q13356 520 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 DGKHQ86XP1 1220 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC17Q96LX7 622 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 RNF7Q9UBF6 113 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 MED23Q9ULK4 1368 aa5.64□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 F8W8V4 182 aa5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS3O15072 1205 aa5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 SPRY2O43597 315 aa5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 IL1R2P27930 398 aa5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 EPHB2P29323 1055 aa5.63□□□□□ -1.51
ATXN3-218ENST00000553309 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms