RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 IRX4P78413 519 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CDR2Q01850 454 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 MESP2Q0VG99 397 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SCAPQ12770 1279 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DCAF6Q58WW2 860 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 NAA35Q5VZE5 725 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.01□□□□□ -0.81
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CS-217ENST00000550044 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DEFB106AQ8N104 65 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 RNF214Q8ND24 703 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 C18orf8Q96DM3 657 aa10.01□□□□□ -0.81
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CS-217ENST00000550044 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 IFNKQ9P0W0 207 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 PCNX2A6NKB5 2137 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 HELZP42694 1942 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 ACACAQ13085 2346 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PQC6 194 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SOWAHDA6NJG2 315 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CFAP99D6REC4 459 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TRIM24O15164 1050 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TSPAN3O60637 253 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 APBB3O95704 486 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CAPNS1P04632 268 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TYRP14679 529 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DRD1P21728 446 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DGKEP52429 567 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SEC13P55735 322 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TBX4P57082 545 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SNX16P57768 344 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 FMO1Q01740 532 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SLC6A3Q01959 620 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 KDSRQ06136 332 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 EMC10Q5UCC4 262 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 PMS2CLQ68D20 193 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 LYPD8Q6UX82 237 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 ZNF677Q86XU0 584 aa10□□□□□ -0.81
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CS-217ENST00000550044 PIGKQ92643 395 aa10□□□□□ -0.81
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CS-217ENST00000550044 P2RY11Q96G91 374 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 LRIG1Q96JA1 1093 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 COX16Q9P0S2 106 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 APC2O95996 2303 aa10□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TENM4Q6N022 2769 aa9.99□□□□□ -0.81
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CS-217ENST00000550044 SLC35F4A4IF30 521 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 LRRC53A6NM62 1247 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 K7EQS6 105 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TULP3O75386 442 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 BCKDHBP21953 392 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 CHKAP35790 457 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 NOMO3P69849 1222 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DMC1Q14565 340 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 C2orf27AQ580R0 203 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 TAC4Q86UU9 113 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 XYLT1Q86Y38 959 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 DDI1Q8WTU0 396 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 AGPAT1Q99943 283 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-217ENST00000550044 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.99□□□□□ -0.81
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