RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548863.1

CNOT2-215, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 3

Gene CNOT2, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-215	ENST00000548863	KAT7	O95251	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	IGFBP2	P18065	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	EGR1	P18146	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	FGFR2	P21802	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SNX27	Q96L92	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	GRID2	O43424	1007 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	NEURL1	O76050	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	IDE	P14735	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	GABRB3	P28472	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SARG	Q9BW04	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	SELENOV	P59797	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	ZP1	P60852	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	TRAF2	Q12933	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	TRAF1	Q13077	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	GPR18	Q14330	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	CADM3	Q8N126	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	FAR2	Q96K12	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	GDF15	Q99988	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-215	ENST00000548863	APAF1	O14727	1248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	PRSS2	P07478	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	TRIM27	P14373	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	PMPCA	Q10713	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	P3H1	Q32P28	736 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863		A0A1W2PPC4	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	NKX2-8	O15522	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	FCGR1A	P12314	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	SLC5A1	P13866	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	GNAL	P38405	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	POLE2	P56282	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	HILS1	P60008	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	CSHL1	Q14406	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	DUSP6	Q16828	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-215	ENST00000548863	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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