RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 GDAP1Q8TB36 358 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SGCDQ92629 289 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RMDN1Q96DB5 314 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 STRA6Q9BX79 667 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCM1Q9NP62 436 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX15Q9NRS6 342 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CEP72Q9P209 647 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PQM1 296 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MROH6A6NGR9 719 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC34A8MYJ7 566 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 AGPSO00116 658 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RFXAPO00287 272 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TP73O15350 636 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP27B1O15528 508 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ENTPD3O75355 529 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 STC2O76061 302 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RECQL4O94761 1208 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRSS23O95084 383 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GDF11O95390 407 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 URODP06132 367 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RB1P06400 928 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FGFR4P22455 802 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUSP1P28562 367 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADORA2AP29274 412 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FMO4P31512 558 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTKP33981 857 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 HSD17B4P51659 736 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 STAT2P52630 851 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPHB3P54753 998 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 HDAC4P56524 1084 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXL2P58012 376 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 NHLH2Q02577 135 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPARDQ03181 441 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 WASHC5Q12768 1159 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRM7Q14831 915 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ISM2Q6H9L7 571 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTI2Q6NXR4 508 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 GALNT7Q86SF2 657 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MON1AQ86VX9 555 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 CARFQ8N187 725 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCML4Q8N228 414 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCUQ8NE86 351 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SETD6Q8TBK2 473 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNJ9Q92806 393 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 BOD1Q96IK1 185 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-928P-201ENST00000516876 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms