RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PER3	P56645	1201 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	APBA1	Q02410	837 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TCF15	Q12870	199 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DRP2	Q13474	957 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ANO5	Q75V66	913 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	VPS52	Q8N1B4	723 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CNNM3	Q8NE01	707 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	URGCP	Q8TCY9	931 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PROB1	E7EW31	1015 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ASAP2	O43150	1006 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	OFD1	O75665	1012 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	STC2	O76061	302 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GALT	P07902	379 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	AVPR2	P30518	371 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	AXL	P30530	894 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	POU5F1B	Q06416	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPN14	Q15678	1187 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	NEK8	Q86SG6	692 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	C4orf19	Q8IY42	314 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR65	Q8IYL9	337 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MDM1	Q8TC05	714 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TCP11	Q8WWU5	503 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MIEF2	Q96C03	454 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	KLC2	Q9H0B6	622 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CSRNP2	Q9H175	543 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	EPC1	Q9H2F5	836 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	POMK	Q9H5K3	350 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	RSAD1	Q9HA92	442 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	INTU	Q9ULD6	942 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC37A4	O43826	429 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MFAP3L	O75121	409 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ABLIM3	O94929	683 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LYPLA2	O95372	231 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CXCL14	O95715	111 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FGFR4	P22455	802 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC11A1	P49279	550 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CLCN4	P51793	760 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CLCN5	P51795	746 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CREM	Q03060	361 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NOTUM	Q6P988	496 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DOK3	Q7L591	496 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR149	Q86SP6	731 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MIER2	Q8N344	545 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	WASF1	Q92558	559 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HDAC10	Q969S8	669 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP4	Q96MN2	994 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LXN	Q9BS40	222 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	LANCL2	Q9NS86	450 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM186A	A6NE01	2351 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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