RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRMS1LQ5PSV4 323 aa17.37■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARCQ7LC44 396 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP30Q70CQ3 517 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XYLT1Q86Y38 959 aa17.36■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.36■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HS3ST4Q9Y661 456 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.36■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOX5P35711 763 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK8P45983 427 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 JAM2P57087 298 aa17.35■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOMO3P69849 1222 aa17.35■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.35■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 OPHN1O60890 802 aa17.34■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC14A1Q13336 389 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM124AQ86V42 546 aa17.34■□□□□ 0.37
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MINDY1Q8N5J2 469 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf216Q8TAB5 229 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALG14Q96F25 216 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPAG5Q96R06 1193 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TKTL2Q9H0I9 626 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTG2Q9H4K7 406 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC32A1Q9H598 525 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VANGL2Q9ULK5 521 aa17.34■□□□□ 0.37
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