RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GVT2 93 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM8BA6NDV4 472 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 CCR1P32246 355 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 ECT2LQ008S8 904 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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ALYREF-203ENST00000511412 HLA-BQ31612 363 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 RABGAP1LQ5R372 815 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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ALYREF-203ENST00000511412 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 COX16Q9P0S2 106 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.48■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 KLK13Q9UKR3 277 aa25.48■■□□□ 1.67
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ALYREF-203ENST00000511412 GRIA4P48058 902 aa25.47■■□□□ 1.67
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ALYREF-203ENST00000511412 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.46■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 CD27P26842 260 aa25.46■■□□□ 1.67
ALYREF-203ENST00000511412 KRT9P35527 623 aa25.46■■□□□ 1.67
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ALYREF-203ENST00000511412 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.45■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.45■■□□□ 1.66
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ALYREF-203ENST00000511412 FLRT2O43155 660 aa25.44■■□□□ 1.66
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ALYREF-203ENST00000511412 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.44■■□□□ 1.66
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ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 SNX11Q9Y5W9 270 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 PLXNA2O75051 1894 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 CLCN1P35523 988 aa25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 PSMD8P48556 350 aa25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 NUMBP49757 651 aa25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 SLC6A3Q01959 620 aa25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 CENPCQ03188 943 aa25.43■■□□□ 1.66
ALYREF-203ENST00000511412 SULT2A1Q06520 285 aa25.43■■□□□ 1.66
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