RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM131BQ86XD5 332 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM1BQ8NB78 822 aa21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 CYP2U1Q7Z449 544 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2T3Q8NH03 318 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 VPS45Q9NRW7 570 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 BCKDHBP21953 392 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 C5orf22Q49AR2 442 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 WDR59Q6PJI9 974 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C14orf80Q86SX3 495 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZBED6P86452 979 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 FRMD1Q8N878 549 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF366Q8N895 744 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM11Q96F44 468 aa21.69■■□□□ 1.06
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