RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SMO	Q99835	787 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP26A1	O43174	497 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GREM1	O60565	184 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FSBP	O95073	299 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HMBS	P08397	361 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RALA	P11233	206 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PGF	P49763	221 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf59	P57076	290 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF234	Q14588	700 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RABEP1	Q15276	862 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQH9	124 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y8X5	98 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC3	O60645	756 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BEST1	O76090	585 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G2A	P14555	144 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCH	P24723	683 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIA4	P48058	902 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	COPA	P53621	1224 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAT1	P54687	386 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ASIC1	P78348	528 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GANC	Q8TET4	914 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ENC1	O14682	589 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DFNA5	O60443	496 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QL1	O75973	258 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	STC2	O76061	302 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4F	O95754	770 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DNTT	P04053	509 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGAV	P06756	1048 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB4	P21439	1286 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CD27	P26842	260 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSL1	P33121	698 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP4	P49662	377 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	NDST1	P52848	882 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	COG7	P83436	770 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	AMPD3	Q01432	767 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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