RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 BTBD19C9JJ37 291 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KPNA5O15131 536 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 GUCY1B2O75343 617 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 IMPDH2P12268 514 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 RFX3P48380 749 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 XRCC4Q13426 336 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ANKRD7Q92527 254 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 HES2Q9Y543 173 aa11.21□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MRC1P22897 1456 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 UBXN8O00124 270 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SERPINE1P05121 402 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CENPAP49450 140 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PLD3Q8IV08 490 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MDM1Q8TC05 714 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 VPS50Q96JG6 964 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CEP41Q9BYV8 373 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TMCO1Q9UM00 188 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 A0A087X1B8 175 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 A0A0A0MRY4 1105 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 UBDO15205 165 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SPTLC1O15269 473 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MAN1A2O60476 641 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ATP9AO75110 1047 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 GLUD1P00367 558 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CTSEP14091 401 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TNNI3P19429 210 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 AIF1P55008 147 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ST3GAL1Q11201 340 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 OVGP1Q12889 678 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ZACNQ401N2 412 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SPRYD7Q5W111 196 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ZNF614Q8N883 585 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SPATA13Q96N96 652 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 QRFPRQ96P65 431 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TISP43B9A030 160 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TRIM13O60858 407 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 NDUFS2O75306 463 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 RASSF9O75901 435 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 RARAP10276 462 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SERPINB5P36952 375 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 NUMBP49757 651 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PCID2Q5JVF3 399 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 VPS33AQ96AX1 596 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 GPR20Q99678 358 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 DPY30Q9C005 99 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 S100A5P33763 92 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MAPK9P45984 424 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 AQP5P55064 265 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 NAA20P61599 178 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MAMLD1Q13495 774 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PEX6Q13608 980 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 BMPR2Q13873 1038 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 FUT11Q495W5 492 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 WDR48Q8TAF3 677 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TTPALQ9BTX7 342 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 CYP1A2P05177 515 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 TYMPP19971 482 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 SOX11P35716 441 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.2□□□□□ -0.62
TTLL3-232ENST00000496526 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms