RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP8P85298 464 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SEC23BQ15437 767 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 RNFT2Q96EX2 444 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRRX2Q99811 253 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF747Q9BV97 191 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPH5 198 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GAGE10A6NGK3 116 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN5O94779 1100 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 F9P00740 461 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ADRB1P08588 477 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ARSAP15289 507 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GSTM2P28161 218 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF84P51523 738 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SHC2P98077 582 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GXYLT1Q4G148 440 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT7Q86SF2 657 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CAGE1Q8TC20 777 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NUAK2Q9H093 628 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MROH8Q9H579 483 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DSCR3O14972 297 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SYN3O14994 580 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SGPL1O95470 568 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CCR9P51686 369 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ADPRHP54922 357 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CDH15P55291 814 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF7P61962 342 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALNT1Q00973 533 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DMWDQ09019 674 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 MTFR2Q6P444 385 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TIMP4Q99727 224 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED4O75132 1171 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 LYL1P12980 280 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD18Q0P651 414 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 KRT32Q14532 448 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NAA25Q14CX7 972 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP161Q6P656 301 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A25Q6T423 547 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 VPS52Q8N1B4 723 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ATP2A3Q93084 1043 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 MCIDASD6RGH6 385 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms