RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TAC4Q86UU9 113 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CEP76Q8TAP6 659 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 UBA3Q8TBC4 463 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MDM1Q8TC05 714 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 STK32AQ8WU08 396 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SHC3Q92529 594 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 EDEM1Q92611 657 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 AZIN2Q96A70 460 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HSFY1Q96LI6 401 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TRIM4Q9C037 500 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 FBRSQ9HAH7 460 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SIX2Q9NPC8 291 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DKK4Q9UBT3 224 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HESX1Q9UBX0 185 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 GGA2Q9UJY4 613 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 BSNQ9UPA5 3926 aa4.51□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 E5RJQ4 531 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 BIN1O00499 593 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ARHGAP33O14559 1287 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TIMM44O43615 452 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DKK1O94907 266 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CYBBP04839 570 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HLA-EP13747 358 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 LCP1P13796 627 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MAPK8P45983 427 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 FAM193AP78312 1265 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 APBA1Q02410 837 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ZBTB16Q05516 673 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 GRIK2Q13002 908 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TAF5Q15542 800 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MPPE1Q53F39 396 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ISM2Q6H9L7 571 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 KLHL10Q6JEL2 608 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 GJB7Q6PEY0 223 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 RRAGAQ7L523 313 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TMEM110Q86TL2 294 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 AHI1Q8N157 1196 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 KDM1BQ8NB78 822 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DEFB124Q8NES8 71 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 OR2T3Q8NH03 318 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 DDI1Q8WTU0 396 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 UCMAQ8WVF2 138 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 FOXJ1Q92949 421 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 TTC17Q96AE7 1141 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 SERPINB11Q96P15 392 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 CIPCQ9C0C6 399 aa4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PHF20-212ENST00000485604 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms